Selon le Cler, ce rapport est ''aveugle vis à vis du nucléaire'' et le Comité rajoute que ''l’AIE ignore ou feint d’ignorer dans son analyse cette incompatibilité fondamentale entre les orientations nucléaires et les orientations du Grenelle''. L'AIE a une vision ''extrêmement optimiste (…) de la situation du programme nucléaire français, qu’il s’agisse de transparence, de gestion des déchets ou de prévisions sur l’allongement de la durée de vie ou l’avènement de la 4e génération''.

Enfin, le Cler dénonce l’absence des ONG dans les réunions consultatives (seule l’Association Nicolas Hulot a été associée aux travaux de l’AIE).

Il en résulte que :

- les émissions de CO2 en France sont parmi les plus basses des pays inspectés par l’AIE (8 tonnes de CO2 par habitant et par an). Ce bon résultat serait dû à « l’importance continue » de l’énergie nucléaire qui représente 80% de la production d’électricité en France. Cependant, le directeur exécutif de l’AIE, Nobuo Tanaka, n’a pas éludé la délicate question des déchets, « inévitable » selon lui.

- les prix de l’énergie nucléaire française sont largement inférieurs à ceux pratiqués sur le marché européen, ce qui rend difficile l’ouverture à la concurrence.

- même si le nucléaire présente un bilan de très grande qualité, on oublie souvent le choix de l’hydraulique qui produit de très bons résultats (85% de la part de production d’électricité par les énergies renouvelables en 2007).

La France a également fait l’objet de remarques générales encourageant le développement des énergies renouvelables.